1、药物副作用：部分女性服药后出现各种各样的药物副作用，如恶心、呕吐、头晕、乏力、腹泻、腹痛、畏寒、发热等，而且药物流成功率不高，有时候出现胚胎不排出或仅部分排出的情况，碰到这些情况还要进一步作人工流产术进行补救。

　　2、月经失调：抗孕药物可以抑制卵巢的功能，影响卵泡的生长发育甚至排卵，个别女性多次药物流产后，会出现月经失调的现象，主要表现为月经周期缩短或延长，月经量增多等。

　　3、不完全流产：有的女性用药后出现不完全流产，影响子宫的收缩及子宫内膜创面的修复，导致阴道流血量增多，超过平时月经量的2-3倍，严重者还可能出现大出血，导致贫血、休克，需要输血、并紧急手术刮宫止血等。

　　4、感染：服用抗孕药物后子宫腔内的胚囊组织一般在当天可排出，有时候妊娠组织物排出不全，子宫膜复旧欠佳，阴道出血时间较长，可以持续2-3周，甚至1-2个月。长期的慢性失血可引起贫血，使身体抵抗力下降。如果细菌通过阴道逆行，就会引起子宫内膜炎症。

　　5、影响以后的正常妊娠：未婚女性如果反复妊娠、反复流产，就会造成子宫内膜反复受损。由于子宫内膜有损伤，以后如果需要正常妊娠，很容易发生前置胎盘，引起产前大出血，也有的女性因多次人工流产而出现习惯性流产。
    6、自然流产率增高：人工流产后常见的并发症为子宫颈损伤，尤其是未婚人工流产宫损伤的可能性会更大，当婚后再次妊娠时会由于子宫颈口功能不全而引起早产或晚期流产。